Cải tạo ao chính là “thời gian vàng” quyết định sự thắng lợi hay thất bại của vụ nuôi mới. Theo kinh nghiệm của những ông chú nuôi lâu năm cải tạo ao là vô cùng quan trọng, nhất là khi dịch bệnh vừa mới xảy ra.
Việc sử dụng vi sinh để kiểm soát mầm bệnh, xử lý môi trường mà đặc biệt là khử nhớt bạt là một phương pháp không còn quá xa lạ và đang dần thay thế vị trí của kháng sinh trong nuôi tôm thâm canh.